北京密云供销合作社前身为北京市密云县供销合作联合社，于2003年8月宣告破产，2005年12月，县委、县政府为了进一步深入国有及城镇集体企业改革、优化企业资源配置、实现国有资产保值增值，决定将县供销社、工业品公司、陛连盛商贸公司、物资总公司、长城工业总公司、医药药材公司共6家企业整合为县供销社一家。2006年10月重新注册了“北京密云供销合作社”和“北京京云天宇商贸有限公司”。在这之后，先后有两家企业划入供销社管理。2009年12月7日北京云建城市建设工程有限公司由北京市密云县房地产开发总公司划归我单位管理的。2013年10月北京天成开元密云市场服务中心由北京古玩城集团划归我单位管理。截至2020年底共有职工561人（其中在册在岗389人，在册不在岗172人），退休职工2736人。
2020年12月底，按照区委办区政府办关于《密云冶金矿山公司等四家区管国有企业改革重组实施方案》文件，京云天宇公司划归至渔阳旅游集团，其下属二级企业药材公司和天成开元市场服务中心一同划转。改革完成后供销社下属企业为冯家峪供销社、太师屯供销社、云建公司和山林丰再生资源回收有限公司。职工总人数145人，在岗108人，退休职工2736人。